御宅族高中生吾妻晴被父亲带到肯亚,表面上是为了进行非洲草原旅游心理治疗,实际上父亲却想杀了他以领取保险金。然而阿晴不单并没有死,反而跟作为「曾经是万物的一部分、所有生物的根源、毁灭一切使之前进的力量的意志统合体」的病毒Will交换契约,成为新人类Omega。自此以后,阿晴得到超乎常人的运动能力,凡接触他的体液的人,会受感染而死亡或被同化成为族人。从鬼门关重拾生命并得到新力量的他产生翻天覆地的改变。在受到另一位次世代新人类伊芙的刺激之后,阿晴决心在三年后的日本发动政变。为此他悉心挑选干部,在民间吸纳无法被社会认同而改变无路的人,在军政界争取在二战后不满日本受列强所制的人,在国外争取支援,并派得力助手原暴走族集团总长梶秋一进入政坛。世上的其余5个Omega(同时亦是政治领袖--中东油王王子、美国总统夫人、中国富豪、罗马教宗、神秘人)亦因为阿晴的出现而分别进行拉拢或打击。
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